二、氏家是凶手，他是那位被欺凌同学的父亲。
三、这两栋小屋实际上在同一栋房屋内，只不过用建筑学巧妙地掩盖住了。
四、在文科班还有一位凶手没有被我们揭露出来……为了引出这位凶手……我们……
“原来如此。”看完后，松田阵平露出一丝拨开云雾般的笑容，准备按照纸条上面说的计划行事。
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许久后，上课铃声响了。
无论是太阳小屋，还是月亮小屋，所有的学生都奔跑着，生怕迟到。
大道寺悠里正在上古文课，那名对乌龙茶过敏的女生称自己肚子不舒服走出去了之后，就再也没有回来……
松田阵平这边的学生们也是一样，最初那位被叫去拿粉笔的学生一去不复返。
接着是他和剩下的学生一起做DNA双螺旋结构的测试题时，提前交卷的学生消失得无影无踪，算起来已经失踪三个人了。
即便是这样，这个补习班也没有停止上课。
第四位失踪的学生是一位在古文随堂测试中疑似作弊的学生，他被严岛赶出教室后，再也没有回来。
在连续失踪了四人的情况下，补习班里负责的严岛老师终于坐不住了，他发动剩下的学生们，让大家结伴在监狱内寻找他们的下落。
“啊！”属于女性尖锐的叫声瞬间响彻了整个监狱。
工藤新一和金田一向着声源地奔跑。
所有失踪的学生，都瞬间冒出来了。
死状各不相同，有被燃烧死，有被吊起，有被竹子捅穿……和他们离开教室时学习到的内容一样的死法。
“我受够了！我不要在这里！”众学生对此嚷嚷着，纷纷想要回家。
在一旁观看着这场闹剧的傀儡师带着满意的笑容。他的最后一环就要扣上了……
“究竟是谁犯下这些罪呢？我们所有人不都有不在场证明么？”高远遥一引导道。
“确实是……他们都是一个人单独离开教室的，失踪的时候我们全部人都在上课，太阳小屋和月亮小屋往返要一个小时，根本不可能有人有犯罪的时间。”剩下的学生们正在思考。
“不是还有一个人么！”学生中有人惊呼，“那个中屋敷！因为作弊在一开始就被关进自习室里的中屋敷！”
“哦！如果他能够随意进出自习室的话，他确实能够做到这些案件！”
一行人随着学生们推理的结果来到中屋敷的房间门外，本应该从外面被上锁的房间，被他们推开了……
推开之后，房间里倒着又一位新的受害人。他留下遗书，承认所有的一切都是他干的。众人唏嘘，却因为案件最终能过落幕感到安心。