大熊答应之后的半年里，贝加班克在治疗波妮的同时展开了克隆士兵的制造。
由于忙得不可开交，他产生了制造分身的想法。
工作之余，他和大熊、波妮、战桃丸、黄猿相处得其乐融融，而波妮也渐渐恢复的健康，并在半年后回到了索尔贝王国疗养。
大约三年前，贝加班克分离大脑，将其存储在了“班克记录”中。
他开始计划用“岛云”将研究所和“大脑”浮在空中。
两年前司法岛事件后，贝加班克开始关注路飞。
大熊向贝加班克透露路飞是龙的儿子，并表示路飞的橡胶能力和他向往的尼卡非常相像。
顶上战争前夕，大熊的改造工作即将完成。
在贝加班克的请求下，大熊在备份了记忆的同时将自己的记忆存储在了一个气泡中。
萨坦圣突然命令贝加班克在大熊身上安置自爆开关。
贝加班克表示想在大熊身上测试能够人格切换的脑回路，被萨坦圣无情否决。
萨坦圣表示他是在对贝加班克下达命令，并称自己也是科学家，贝加班克别想糊弄自己。
之后，即将失去意识的大熊让贝加班克给自己设置了保护草帽一伙的船只的任务。
伴随着悲伤和不舍，贝加班克拉下了最后的开关，大熊彻底失去了意识。
而贝加班克并没有遵照萨坦圣的命令，他给大熊体内安装了“完全停止开关”，如果按下开关大熊则会陷入植物人状态，而不会引爆。
格赫德事件三个月前，约克联络五老星，向政府透露贝加班克正在研究“空白的一百年”。
在测试了母火种后，萨坦圣率领海军前往艾格赫德抹杀贝加班克。
事件两周前，贝加班克和释迦、毕达哥拉斯在发现融合炉的数值异常后展开了调查。